A WebBér és a bérszámfejtő program adatbázisait folyamatos és automatikus adatszinkronizálás kapcsolja össze, mintha az online adatbázis a bérszámfejtő program adatbázisának a Webes kiterjesztése volna. A folyamatos szinkronizálás biztosítja a két adatbázis egyezőségét. A bérszámfejtések a WebBérben zárolják a számfejtés alapját képező adatok számfejtés utáni módosítását. A WebBér egyelőre csak a Novitax bérszámfejtő programjával kompatibilis, a más programokhoz való illesztését import/export megoldással tervezzük. A WebBér online felületén a munkaszervezési feladatot ellátó jogosultságú felhasználók folyamatosan jelezhetik a személyi adatokban történő változásokat, vezethetik a jelenlétet, a ténylegesen ledolgozott időt, munka (projekt) és költséghely számonként, óra, perc bontásban is. Az online felületen kezdeményezett változások, munkaidővel kapcsolatos adatok automatikusan kerülnek át a bérszámfejtő programba (mintha ott rögzítették volna). A kezdeményezett változásokat átvezetésük előtt a bérszámfejtő áttekintheti, vagy áttekintés nélkül, automatikusan beírathatja az adatbázisba, de nem neki kell rögzítenie. A WebBér felületein tehát a munkavállalók, és a munkaszervezési feladatokat ellátók a számfejtési időszak kezdetéig teljes mértékben előkészíthetik a számfejtést, a bérszámfejtőnek csak az ellenőrzési és számfejtési feladatokat kell ellátnia.